Les fichiers ou dossiers crées automatiquement par un script php, par exemple, ne peuvent etre effacés que par un script php. Ce n'est pas une question de CHMOD mais une question de propriétaire. Les fichiers crées automatiquement appartiennent à Apache et seul lui peut les effacer.
Si vraiment vous bloquez, envoyer un email au Staff avec la liste des dossiers à effacer et ça sera fait.